Opis
Wyrób VIM/NDM carbapenemase (qPCR) służy do oznaczania sekwencji genów kodujących karbapenemazy VIM i NDM w preparatach DNA uzyskanych z materiału pobranego od człowieka.
Cechy produktu
Wielkość zestawu: 100 oznaczeń
Reakcja: triplex (FAM: karbapenemazy z grupy VIM, HEX: kontrola wewnętrzna, Texas Red: karbapenemazy z grupy NDM)
Kontrola wewnętrzna: egzogenna/endogenna
Oznaczenie: jakościowe/ilościowe
Składniki zestawu:
- Mieszanina reakcyjna: zawiera polimerazę DNA, sondy i startery oraz inne składniki reakcji qPCR;
- Kontrola pozytywna;
- Kontrola negatywna;
- Woda PCR-grade;
- Kontrola wewnętrzna
Oporność na karbapeny
Najczęstszym mechanizmem oporności pałeczek Enterobacterales na karbapenemy jest produkcja karbapenemaz, do których należą głównie KPC, NDM, VIM, IMP i OXA-48-like. Większość z nich jest kodowana na plazmidach. W związku z tym geny oporności na karbapenemy łatwo rozprzestrzeniają się poprzez poziomy transfer genów. Innym mniej powszechnym mechanizmem oporności na karbapenemy jest połączenie ekspresji beta-laktamaz o rozszerzonym spektrum (ESBL) lub AmpC i utraty poryn lub nadmiernej ekspresji pomp wypływowych.
Pałeczki oporne na karbapenemy (CRE, carbapenem-resistant Enterobacterales) w wyniku pierwszego mechanizmu określane są mianem CRE produkujących karbapenemazy (CP-CRE). Natomiast Enterobakteriales oporne na karbapenemy w wyniku drugiego mechanizmu określa się mianem CRE nieprodukujących karbapenemazy (non-CP-CRE).
Karbapenemazy VIM i NDM
Obydwa typy oznaczanych karbapenemazy te należą do β-laktamaz zaliczanych do klasy B (MBL). Klasa MBL stanowi najbardziej odrębną linię ewolucyjno-strukturalną tych enzymów, a w jej specyfice funkcjonalnej najbardziej wyróżniają się zależność od jonów cynku i naturalna zdolność do hydrolizy karbapenemów. Spektrum substratowe zdecydowanej większości MBL jest bardzo obszerne i obejmuje też penicyliny i cefalosporyny I-IV generacji.
Pierwszy gen kodujący karbapenemazę VIM (Verona Integron-Encoded Metallo-beta-lactamase) zidentyfikowano pod koniec 1997 roku u P. auregionasa w Weronie we Włoszech. Od tego czasu opisano ponad 69 wariantów tego genu. Warianty VIM występują głównie u gatunków Pseudomonas, Acinetobacter i Enterobacteriaceae, które występują na całym świecie. Natomiast karbapenemazę NDM po raz pierwszy zidentyfikowano w 2008 roku w izolacie Klebsiella pneumoniae pobranym od szwedzkiego pacjenta hospitalizowanego w Indiach.
Pierwszego członka karbapenemaz z grupy NDM po raz pierwszy zidentyfikowano w 2008 roku w izolacie Klebsiella pneumoniae pobranym od szwedzkiego pacjenta hospitalizowanego w Indiach. Od miejsca odkrycia tej grupy enzymów wywodzi się ich nazwa: NDM, New Delhi metallo-β-lactamase.
