Opis
Wyrób Fusarium oxysporum (qPCR) służy do wykrywania sekwencji charakterystycznych dla patogennych szczepów Fusarium oxysporum w preparatach DNA uzyskanych z materiału biologicznego pobranego lnu.
Cechy produktu
Wielkość zestawu: 100 reakcji
Reakcja: duplex (FAM: Fusarium oxysporum, HEX: kontrola wewnętrzna)
Kontrola wewnętrzna: egzogenna/endogenna
Oznaczenie: jakościowe/ilościowe
- Składniki zestawu:
- Mieszanina reakcyjna: zawiera polimerazę DNA, sondy i startery oraz inne składniki reakcji qPCR;
- Kontrola pozytywna;
- Kontrola negatywna;
- Woda PCR-grade;
Opis patogenu Fusarium oxysporum
Fusarium oxysporum jest głównym patogenem wielu ważnych upraw na całym świecie powodującym zgniliznę koron i korzeni, a także więdnięcie naczyniowe. Grzyb przenoszony przez glebę atakuje bardzo szeroką gamę roślin żywicielskich, w tym cebulę, por, sałatę, pomidor, kapustne, szparagi, dyniowate, paprykę, kolendrę, szpinak, bazylię, fasolę, groch, truskawki, arbuz i banany. Jest również ważnym patogenem upraw nieżywnościowych, takich jak goździki i narcyzy. Choroby roślin powodowane przez grzyby z rodzaju Fusarium określa się wspólnym mianem fuzarioz.
Szeroki zakres żywicieli, a także wpływ gospodarczy i naukowy sprawiły, że F. oxysporum został uznany za piąty najważniejszy grzyb chorobotwórczy dla roślin. Fusarium oxysporum to zbiór podgatunków/szczepów obejmujący zarówno izolaty niepatogenne, jak i patogenne. Niepatogenne izolaty F. oxysporum powszechnie występują w glebie jako saprofity. Patogenne izolaty F. oxysporum wyróżnia się jako formy wykazujące specyficzność względem żywiciela (f. spp., formae spp.). Dotychczas zidentyfikowano ponad 120 form F. oxysporum o różnej specyficzności względem żywiciela.
F. oxysporum wydziela małe białka efektorowe w ksylemie, określane jako Secreted in Xylem (SIX), które przyczyniają się do jego zjadliwości. Większość tych białek zawiera reszty cysteiny w parzystych ilościach. Białka te są kodowane przez geny SIX znajdujące się na ruchomych chromosomach patogeniczności (mobile pathogenecity chromosomes). Są to chromosomy nadające patogenność i ulegające horyzontalnemu transferowi.
Do tej pory opisano 14 białek SIX. Nabycie ruchomych chromosomów patogeniczności kodujących białka SIX przez linie niepatogenne w wyniku transferu horyzontalnego skutkuje powstawaniem nowych linii zjadliwych. Niektóre geny SIX obecne na chromosomach patogeniczności biorą również udział w definiowaniu zmienności specyficzności względem gospodarza wśród szczepów F. oxysporum.



