Zaloguj się, aby zobaczyć ceny
Podane ceny są cenami netto
Wyrób CHEK2 rs121908698 – IVS2+1G>A (qPCR) służy do genotypowania polimorfizmu rs121908698 położonego w obrębie ludzkiego genu CHEK2 kodującego kinazę zaangażowaną w kontrolę cyklu komórkowego (Checkpoint Kinase 2). Materiałem do analizy są preparaty DNA zawierające ludzki materiał genetyczny.
Wielkość zestawu: 100 reakcji
Reakcja: dyskryminacja alleliczna z użyciem sond Taqman (FAM: allel typu dzikiego, HEX: allel niosący mutację IVS2+1G>A)
Oznaczenie: jakościowe/ilościowe
Badany genom: człowieka (Homo sapiens)
Składniki zestawu:
Wyrób CHEK2 rs121908698 – IVS2+1G>A (qPCR) opiera się na technice genotypowania z użyciem sond Taqman. Fragment DNA otaczający polimorfizm rs121908698 jest namnażany prze parę starterów i wykrywany przez parę sond Taqman. Sonda znakowana barwnikiem FAM jest komplementarna do sekwencji zawierającej cytozynę (allel typu dzikiego, allel C), natomiast sonda znakowana barwnikiem HEX – do sekwencji zawierającej tyminę (allel zmutowany, allel T).
Podczas reakcji sondy te konkurują ze sobą o związanie się do matrycy. Sonda, która jest w 100% homologiczna do nici DNA wiąże się z nią preferencyjnie w stosunku do sondy alternatywnej. W miarę postępu reakcji pojawia się silny sygnał dla sondy w pełni homologicznej i słaby sygnał dla sondy alternatywnej. Genotyp próbki określa się przez porównanie stosunku intensywności sygnałów między dwoma kanałami (FAM i HEX). Dla próbek homozygotycznych otrzymuje się silny sygnał na jednym kanale i słaby na drugim kanale. W przypadku próbek heterozygotycznych, które zawierają miejsca wiązania dla każdej z sond, otrzymuje się sygnał pośredni na obydwu kanałach.
W literaturze polimorfizm IVS2+1G>A również opisany jako polimorfizm 444+1G>A. Polimorfizm ten polega na tranzycji C→T. W allelu typu dzikiego występuje cytozyna (C, nukleotyd 28725242 na chromosomie 22). W allelu alternatywnym występuje tymina (T). Mutacja IVS2+1G>A występuje w intronie za egzonem 2 i jest mutacją typu „utrata funkcji („loss of function”). Jego obecność prowadzi do nieprawidłowego wycinania intronu na etapie transkrycji. W wyniku tego dochodzi do zmiany ramki odczytu („frameshift”) i powstania niefunkcjonalnego białka.
W bazie dbSNP (NCBI) mutacja IVS2+1G>A jest opisana pod numerem rs121908698. Polimorfizm rs121908698 po raz pierwszy został opisany w 2002r. jako czynnik zwiększający ryzyko zachorowania na raka prostaty. Późniejsze badania wykazały, że mutacja IVS2+1G>A zwiększa także ryzyko zachorowania na piersi, jelita grubego, nerki i tarczycy.
