Zaloguj się, aby zobaczyć ceny
Podane ceny są cenami netto
Wyrób BRCA1 rs28897672 – Cys61Gly (qPCR) służy do genotypowania polimorfizmu rs28897672 położonego w obrębie ludzkiego genu BRCA1 kodującego białko uczestniczące w naprawie DNA i zaliczane do supresorów nowotworowych (Breast cancer type 1 susceptibility protein). Materiałem do analizy są preparaty DNA zawierające ludzki materiał genetyczny.
Wielkość zestawu: 100 reakcji
Reakcja: dyskryminacja alleliczna z użyciem sond Taqman (FAM: allel typu dzikiego, HEX: allel niosący mutację Cys61Gly)
Oznaczenie: jakościowe/ilościowe
Badany genom: człowieka (Homo sapiens)
Składniki zestawu:
Wyrób BRCA1 rs28897672 – Cys61Gly (qPCR) opiera się na technice genotypowania z użyciem sond Taqman. Fragment DNA otaczający polimorfizm rs28897672 jest namnażany przez parę starterów i wykrywany przez parę sond Taqman. Sonda znakowana barwnikiem FAM jest komplementarna do regionu DNA zawierającego adeninę (allel typu dzikiego, allel A), natomiast sonda znakowana barwnikiem HEX – do regionu DNA o sekwencji zawierającej cytozynę (allel zmutowany, allel C).
Podczas reakcji sondy te konkurują ze sobą o związanie się do matrycy. Sonda, która jest w 100% homologiczna do nici DNA wiąże się z nią preferencyjnie w stosunku do sondy alternatywnej. W miarę postępu reakcji pojawia się silny sygnał dla sondy w pełni homologicznej i słaby sygnał dla sondy alternatywnej. Genotyp próbki określa się przez porównanie stosunku intensywności sygnałów między dwoma kanałami (FAM i HEX). Dla próbek homozygotycznych otrzymuje się silny sygnał na jednym kanale i słaby na drugim kanale. W przypadku próbek heterozygotycznych, które zawierają miejsca wiązania dla każdej z sond, otrzymuje się sygnał pośredni na obydwu kanałach.
Według bazy dbSNP (NCBI) aktualnie mutacja Cys61Gly jest opisana pod numerem rs28897672 jako transwersja A→C w pozycji 43106487 chromosomu 17. Odmienna nomenklatura polimorfizmu rs28897672 (transwersja A→C) w stosunku do nomenklatury mutacji w obrębie genu (transwersja T→G) wynika z tego, że gen BRCA1 jest położony na chromosomie w orientacji przeciwnej do numeracji chromosomu. Allel typu dzikiego posiada adeninę (A) w miejscu polimorficzym. Allel zmutowany posiada cytozynę (C). Na poziomie DNA mutacja polega na zamianie tyminy na guaninę, co skutkuje zamianą aminokwasu cysteiny na glicynę w pozycji 61 białka BRCA1. Inne alternatywne nazwy mutacji Cys61Gly to c.181T>G, 300T>G oraz C61G.
Mutacja Cys61Gly jest mutacją typu missens występującą w obrębie regionu kodującego motyw palca cynkowego typu RING. Motyw RING zawieraj osiem konserwowanych aminokwasów w postaci cysteiny i histydyny tworzących dwa miejsca wiążące jony cynku Zn2+. Mutacja Cys61Gly usuwa jedno z tych miejsc i tym samym zaburza tworzenie homodimeru białka BRCA1. W populacji polskiej udział mutacji Cys61Gly wśród wszystkich mutacji obserwowanych w genie BRCA1 wynosi ok. 20%.
